Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPBP14678 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms