Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACTN1P12814 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms