Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RLBP1P12271 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RLBP1P12271 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms