Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUP10909 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLUP10909 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLUP10909 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLUP10909 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLUP10909 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms