Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHGAP10645 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHGAP10645 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHGAP10645 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHGAP10645 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHGAP10645 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHGAP10645 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHGAP10645 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms