Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GLI4P10075 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GLI4P10075 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GLI4P10075 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GLI4P10075 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GLI4P10075 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GLI4P10075 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GLI4P10075 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI4P10075 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms