Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI2P10070 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI2P10070 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI2P10070 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI2P10070 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI2P10070 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI2P10070 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI2P10070 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms