Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGA3P0DJD8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms