Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD1P0DJD0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms