Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM228BP0C875 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms