Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PKHD1P08F94 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PKHD1P08F94 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms