Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIT2O94813 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms