Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSO75390 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSO75390 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CSO75390 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms