Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CYTIPO60759 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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