Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPLO60437 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPLO60437 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPLO60437 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPLO60437 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPLO60437 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms