Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA0556O60303 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA0556O60303 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms