Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1GO43497 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1GO43497 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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