Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRTM2O43300 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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