Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASKO14936 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASKO14936 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CASKO14936 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASKO14936 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASKO14936 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms