Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QRK9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QRK9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QRK9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
J3QRK9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3QRK9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3QRK9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
J3QRK9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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