Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISM1B1AKI9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms