Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSDA5PKW4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSDA5PKW4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms