Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms