Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms