Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms