Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD7AQ9UPZ6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD7AQ9UPZ6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms