Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS3Q9UNS2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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