Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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