Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV0

MYO5B, Unconventional myosin-Vb, humanhuman

Predictions only

Length 1,848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5BQ9ULV0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MYO5BQ9ULV0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms