Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRID1Q9ULK0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRID1Q9ULK0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRID1Q9ULK0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRID1Q9ULK0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRID1Q9ULK0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRID1Q9ULK0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRID1Q9ULK0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRID1Q9ULK0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRID1Q9ULK0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRID1Q9ULK0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms