Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GGA2Q9UJY4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms