Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRP68Q9UHB9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms