Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF2Q9UG63 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms