Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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RNF7Q9UBF6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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RNF7Q9UBF6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RNF7Q9UBF6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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RNF7Q9UBF6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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RNF7Q9UBF6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RNF7Q9UBF6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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