Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCHIP1Q9P0W5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms