Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RDH8Q9NYR8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms