Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VNN3Q9NY84 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VNN3Q9NY84 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms