Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC25Q9NXE8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms