Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms