Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG3Q9NT62 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG3Q9NT62 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms