Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBQLN4Q9NRR5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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