Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SDHAF3Q9NRP4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SDHAF3Q9NRP4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms