Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCM1Q9NP62 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCM1Q9NP62 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCM1Q9NP62 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GCM1Q9NP62 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCM1Q9NP62 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms