Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC52A2Q9HAB3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A2Q9HAB3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms