Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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FOXQ1Q9C009 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXQ1Q9C009 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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