Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM31Q9BZY9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM31Q9BZY9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms