Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM55Q9BYV6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms