Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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LRRC3Q9BY71 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC3Q9BY71 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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