Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABARAPL3Q9BY60 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms