Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PACSIN1Q9BY11 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms